הפרעה בבליעה יכולה להיות כתוצאה מחסימה של הושט על רקע תהליך גידולי או על רקע של היצרות שפירה. לעיתים הבעיה נובעת מתנועתיות לא תקינה של הושט. ההפרעה בתנועתיות יכולה להיתבטא בהיתכווצות סימולטנית של הושט עם הפרעה בהרפית הסוגר התחתון (Achalasia).
בשלב האיבחוני יש בדרך כלל צורך בביצוע גסטרוסקופיה ולעיתים שיקוף של הושט עם בליעת בריום. במידה וקים חשד להפרעה בתנועתיות הושט מבוצעת בדיקת מנומטריה, מדידת לחצים בושט. קיימת גם אפשרות להערכת השפעת החומצה על תלונות החולה ע"י ביצוע ניטור של החומצה בושט לאורך 24 שעות.